Миллиарды лет назад на планету Земля прилетели пришельцы, называющие себя «Uranus» (мы их будем называть Создатели), с целью создать живых существ и набрать из них армию для своих военных нужд. В течении миллионов лет они экспериментировали, управляли экосистемой пытаясь создать существ, которые были бы сильны, умны, послушны, могли приспосабливаться к изменениям окружающей среды и самое главное – имели воинственный характер. Первым продуктом претендующим на должность таких существ были динозавры, но хотя они и имели огромные размеры и физическую силу, они были глупы и совсем не умели адаптироваться к изменениям окружающей среды. Поэтому Создатели решили сильно изменить ход своих разработок изменив окружающую среду Земли метеоритным ударом. Это привело к исчезновению динозавров в пользу развития млекопитающих. В ходе новых экспериментов Создатели разработали оптимальную форму жизни - человека, которая должна была служить базой для биооружия - Зоаноидов. Зоаноидом называется человек прошедший специальную обработку и по желанию способный «превращаться в монстра»: изменялась масса, внешний вид человека, увеличивалась физическая сила и добавлялись новые способности. Для управления армиями Зоаноидов был создан Зоалорд и назван именем Алканфель (Арканфель, Арханфер). Это был человек сильно отличающийся внешним видом от остальных людей того времени, у него была гладкая белая не покрытая волосами кожа и худощавое телосложение. Создатели наделили Алканфеля способностью полностью управлять Зоаноидами телепатически, как делали сами, а также огромной энергией, которая давала ему невероятную силу. Алканфель был высшим достижением разработок Создателей на Земле. Далее Создатели хотели произвести ещё 11 Зоалордов и свыше миллиарда Зоаноидов и отправиться на огромных кораблях в космос. Но один из Создателей решил провести ещё один внеплановый эксперимент, так как видел в людях много скрытого потенциала. Человек был совмещён с Био-бронёй, защитной системой, которая использовалась Создателями в качестве скафандра. Создатели постоянно находились в Био-броне, которая помимо увеличения их силы, по видимому, давала им некоторые специальные защитные и атакующие возможности. Создателям было интересно, как повлияет их Био-броня на существо, которое создавалась как оружие. Против человека в Био-броне был выставлен динозавр прошедший процедуру похожую на превращение в Зоаноида и имел мощность примерно как целый отряд Зоаноидов. В ходе боя, человек с лёгкостью победил динозавра, разрубив его Вибрирующими Лезвиями, являющимися частью Био-брони. Создатели были поражены, они не ожидали, что способности человека будут на столько улучшены. Как оказалось человек становился примерно в 10 раз мощнее, чем становились Создатели, одевая Био-броню (или броня усиливала человека в 10 раз сильнее, чем усиливала Создателей). Тут же на радостях они решили, что эксперимент заслуживает внимания и что планы нужно менять. Они приказали человеку снять Био-броню и возвратиться в обычное состояние, но человек их не послушал, а выстрелил по одному из кораблей Создателей из Мега-сокрушителя. Мощьнейшый поток частиц пронзил насквозь корабль нанеся колоссальный ущерб. Создатели в шоке приказали Алканфелю уничтожить человека, направив на него несколько отрядов Зоаноидов. Но это не помогло, человек убил всех Зоаноидов в считанные секунды. Тогда Создатели направили в бой самого Алканфеля, дав ему Ремувер - прибор способный отделить Био-броню от человека. Алканфель заявил, что ему не нужно такое оружие, но Создатели боялись, что без него он проиграет и тогда они ни как не смогут остановить человека в Броне. Когда Алканфель направлялся к человеку, тот выстрелил из Мега-сокрушителя, Алканфель легко противостоял атаке и добился своего - снял броню, направив на человека Ремувер, а потом по приказу Создателей убил его «взглядом». После этого эксперимента Создатели посовещались и решили покинуть планету и уничтожить её, они увидели в своём творении - человеке большую опасность, так как соединённый с Био-бронёй, которую они использовали ежедневно, он становился полностью не контролируемым, обладая сокрушительной силой. И это был человек, даже не прошедший преобразование в Зоаноида, а что было бы, если Био-броню заполучил Зоалорд? Наверняка его сила превысила бы силу самих Создателей, в том смысле, что такое существо могло запросто уничтожить их всех. И вот, совершенно неожиданно, все корабли Создателей одновременно начали подниматься в небо. Алканфель, увидев это, взлетел и отправился за ними, желая узнать причину их внезапного отлёта. Они объяснили ему, что эксперимент на Земле окончился провалом, а на просьбу Алканфеля взять его с собой ответили отказом, сказав ему, что он потенциально вне контроля и не пригоден. Алканфель спросил: "Почему тогда вы создали нас?" Ответом Создателей был мощнейший удар молнии, который пронзил и парализовал Алканфеля (это был мысленный приказ Алканфелю - не двигаться). Улетая создатели назвали Гайвером человека совмещённого с их Био-бронёй, это слово означало на их языке что-то "вне контроля" или "за пределами нормы". Через секунды корабли скрылись в открывшихся порталах, а ещё через несколько открылся другой портал, через который по направлению к Земле летел огромный астероид, размером с Марс. Алканфель видел это и смог разбить астероид расширив до огромных размеров своё защитное поле и полетев ему навстречу. Сравнительно небольшие остатки метеорита обрушились на Землю и вызвали глобальное изменение климата, но человечеству удалось выжить, так как Создатели позаботились наделить его способностью адаптироваться. Алканфель был сильно ранен и нуждался во сне, он поместил себя в одну из капсул для подпитки энергией в корабле Создателей, разрушенном Гайвером. Со временем из-за перемещения материков это место превратилось в небольшой остров, а люди жившие на нём построили храм вокруг корабля, где спал их спаситель...

    Через десятки тысяч лет после отбытия Создателей, примерно в 1600 году на этот остров (остров Silha) случайно попал человек преклонного возраста - Хамилкал Балкус. Он плыл на гражданском корабле из Португалии в Бразилию и потерпел крушение возле берегов Силхи, так как там были постоянные штормы из-за сильного психического поля излучаемого останками корабля Создателей. Очнувшись на берегу он начал осматриваться и наткнулся на невероятных созданий: русалки, гигантские стрекозы и птицы, динозавры. В страхе бежав от них он споткнулся прямо возле лестницы ведущей к входу в храм Алканфеля. Балкус почувствовал, что его кто-то ждёт внутри и пошёл вверх. Войдя внутрь он обнаружил спящего Алканфеля в капсуле. Дотронувшись до капсулы, Балкус разбудил Алканфеля. Тот поведал Балкусу свои намерения, он хотел создать ещё 11 Зоалордов, набрать армию Зоаноидов и отправится в космос за Создателями. Один из Зоакристалов Алканфеля был вынут из его тела и на его основе были созданы остальные 11, один из которых достался Балкусу и сделал его Зоалордом. Всё последующее время до наших дней Балкус искал оставшихся 10-ых людей. После того, как все были в сборе, были построены специальные базы и завершено создание организации Кронос. Через некоторое время Балкус обнаружил, что Алканфель не совсем здоров и его состояние ухудшается. Алканфеля не было видно целый год и Балкус, отправившись на Силху, обнаружил его лежащим на полу без сознания. Оказалось, что Алканфель периодически впадал в что-то наподобие комы и продолжительность таких периодов всё более возрастала... 

    ...В наши дни на одной из баз Кроноса, расположенной внутри горы Минаками в Японии, в ходе исследования уцелевшего корабля Создателей были обнаружены три блока Био-брони и один Ремувер. Агито Макишима, который хотел их заполучить, организовал похищение блоков. Исполнителем стал Зоаноид по имени Малмот тестовый образец. За ним была организована погоня и в итоге его зажал в угол отряд бойцов Кроноса в районе горы Нарисава. Малмот в ходе сопротивления взорвал гранату в непосредственной близости с собой и кейсом с блоками и погиб. Блоки разлетелись во все стороны и один из них приземлился рядом с Шо Фукамачи и Тецуро Сегава, которые отдыхали возле озера после окончания учебного дня. Шо с любопытством начал рассматривать блок и случайно активировал его, после чего, превратился в Гайвера 1. Отряд Кроноса нашёл 1 блок, который был повреждён и продолжая поиски вышел прямо к тому месту, где был Тецуро. Один из бойцов был в форме Зоаноида Грегола и захотел убить Тецуро, но тут появился Гайвер 1 и легко расправился с ним. С этого момента Кронос пытается захватить Гайвера 1, а точнее его Контрольное Устройство, отправляя за ним Зоаноидов и похищая его друзей. Второй блок Био-брони был активирован инспектором американского отделения Кроноса, Освальдом Лискером, в ходе его осмотра. Лискер стал Гайвером 2 и решил сам пойти захватить Гайвера 1. В ходе драки преимущество было на стороне Лискера, так как он был отлично тренированным бойцом, но его контрольное устройство дало сбой из-за повреждения и Гайвер 1 выбил его, после чего Лискер погиб. В Японию прибывает один из Зоалордов, Рихард Гиот, чтобы сменить на посту командующего Гензо Макишиму, который был обвинён в неудачах по возвращению блоков. На самом деле его основной целью было получение одного из блоков для себя, чтобы стать Гайвером-Зоалордом и предать Кронос. Такое отступничество Гиота можно объяснить тем, что когда он проходил превращение в Зоалорда, Алканфель находился во сне и слабо мог контролировать других Зоалордов. Гиот отправил за Гайвером 1 своего Гипер Зоаноида, Зербубуса, но тот был убит неожиданно появившимся Гайвером 3. Это был Агито Макишима, который всё таки заполучил один блок. Гензо Макишима был превращён в Энзайма, специального Зоаноида, способного кислотой легко разъедать броню Гайвера. В драке с Энзаймом Гайвер 1 потерпел поражение, скорее по неопытности, и его Контрольное устройство было вырвано и отправлено в штаб квартиру Кроноса. Через некоторое время Контрольное Устройство неожиданно начало восстанавливать Гайвера 1 и когда процесс завершился, он в несознательном состоянии начал убивать окружающих Зоаноидов и придя в себя оказался рядом с камерой, в которой был заключён его друг Тецуро. В это же время Гайвер 3 уничтожал колбы с проходящими обработку Зоаноидами и устроил несколько взрывов в здании штаб квартиры, после чего небоскрёб был полностью разрушен. Агито думал, что Гиот погиб при разрушении штаб квартиры, но придя домой, обнаружил его в своей гостиной. Гиот скорее всего уже догадывался, что Гайвер 3 это Агито, но не показывал этого. Агито трансформировался в Гайвера и напал на Гиота, но тот показал огромную силу и позвал на помощь команду Потерянных Юнитов трёх “неудавшихся Зоаноидов” (Аптом, Сомлум и Дайм) и Гайвер 3 отступил сбежав. В это время Кроносом были захвачены отец Шо – Фумио Фукамачи и Тецуро с Мизуки. Гайвер 1 направляясь спасти друзей и отца был заманен в ловушку тремя Потерянными Юнитами, но вмешавшийся Масаки Мураками помог ему. Сомлум и Дайм были убиты, а Аптом отозван на базу. Шо и Масаки отправились вместе на базу Кроноса в горе Минаками, где уже начал действовать Гайвер 3, освободив Фумио и остальных. Когда они пытались выбраться с базы на них напала “Команда Гипер Зоаноидов Пять” (Зэкстол, Дэрзерб, Элеген, Гастер и Танкрус). Тут же подоспел Гайвер 1, и им удалось спасти Тецуро и Мизуки, но отец Шо всё же был схвачен и превращён в Энзайма 2. Ночью, Шо и Агито на пару направились выручать Фумио и без особого труда выбрались с ним на поверхность, где на них напала тройка из команды Гипер Зоаноидов 5. Гайвер 3 остался сражаться с ними и убил Танкруса, а Гайвер 1 бежал к укрытию с отцом на плечах. Тут Фумио трансформировался в Энзайма 2 и начал драться с Шо. Шо не мог нормально сражаться с отцом и получил повреждение мозга, после чего Гайвер начал бессознательную деятельность и убил Энзайма 2. В последствии Шо на некоторое время потерял возможность трансформироваться из-за психологической травмы. На Шо и остальных было новое нападение несколькими Энзаймами 2 и сражаться с ними пришлось Мураками и Агито. Кое-как справившись и не успев передохнуть, против них вышел сам Гиот в боевой форме Зоалорда. В ходе битвы он совершил сильный взрыв, потерял сознание и думал, что уничтожил Гайвера 3 и Мураками, но тем удалось скрыться пробив дыру в земле. Отряды Кроноса прочёсывали местность, пытаясь найти Гайвера 1 и найдя его, были убиты Аптомом, который был уже вне контроля доктора Балкуса, сильно модифицировавшего его. Аптом хотел отомстить за своих друзей, Сомлума и Дайма, сразившись самому с Гайвером 1, и у него получилось вернуть Шо способность трансформироваться, начав издеваться над Мизуки. Аптом был побеждён, но не убит.

    Лишившись большей части тела, он подстерёг приближавшуюся четвёрку Гипер Зоаноидов и набросился на Элегена, поглотив его, после чего скрылся. Новым укрытием компании послужил последний уровень базы Кроноса внутри горы Минаками, где им помог схорониться доктор Одагири с небольшой группой учёных (в том числе и Хайами). Чуть позже возле горы Минаками появился Алканфель. Он столкнулся с Аптомом и оставил от него только руку и голову выстрелив мощным лучом и направился на базу. Алканфель знал, что Гиот прячет Ремувер и все его намерения. Он приказал Гиоту отдать Ремувер, но тот отказался и при попытке бежать ввязался в драку. Алканфеля засосало в чёрную дыру созданную Гиотом, которую он потом еле закрыл и то, с помощью доктора Балкуса. В это время Гайвер 1 и Гайвер 3 проникли в Корабль Создателей и Шо удалось взять контроль над ним. А Аптому удалось восстановится, проникнуть на базу и поглотить Дэрзерба и Гастера. Аптом также смог взять образец Зекстола, схватив его за ногу и начав поглощать, но тот отстрелил её и скрылся. Гиот закрыв чёрную дыру упал на нижний уровень и столкнулся с Мураками и Гайвером 1. Он обрадовался и призвал Ремувер, потом попытался снять Био-броню с Агито, но энергии не хватило. Мураками, выстрелив по Гиоту, смог выиграть время, чтобы все успели зайти в Корабль Создателей и он начал взлетать. Когда Мураками уже собирался войти в Корабль, его схватил Гиот и начал избивать. Шо не выдержал и вылез из Корабля, а за ним и Агито. Гиот опять попытался снять с Гайвера 3 броню, но им помешали 10 Зоалордов, которые начали обстрел Корабля, чтобы не дать Гайверам уйти. Гиот попытался скрыться с Ремувером и был остановлен Алканфелем, который, видимо, без труда выбрался из чёрной дыры. Он парализовал Гиота и вынул его Зоакристал. Когда он хотел забрать и Ремувер, Гайвер 3 выстрелил Гравитационной Сферой в Гиота и тот упал куда-то вниз вместе с Ремувером. Тут же Гайвер 1 и Гайвер 3 решили атаковать Алканфеля Мега-сокрушителями, но Алканфель одной рукой отразил их выстрел, направив его обратно и уничтожив Корабль Создателей. В этот момент Шо, почти растворившись, имея связь с Кораблём, пожелал чтобы его компания телепортировалась в безопасное место, а для себя силу способную победить Алканфеля. Его друзья телепортировались в район горы Нарисава, а его Контрольное устройство слилось с Навигационными сферами Корабля и образовало огромный кокон, в котором в течении года формировался Гигантик (Гигантский) Гайвер. Кокон перенёсся в горы на границе штата Монтана (США) и Канады и был найден Кроносом. Год компания скрывалась в доме Нацуки, а Аптом незаметно наблюдал за ними, ожидая возвращения Гайвера 1 для мести.

   17 августа 199х года Кронос захватил всю Землю всего за один день. Агито Макишима создал организацию сопротивления “Молния Зевса” и искал, где Кронос прячет кокон. В Токио для поимки Аптома был выпущен Нео-Зэкстол. Их бой привлёк внимание компании, они думали, что Шо вернулся и побежали смотреть. Аптом проигрывал и Мизуки, считая что это Шо, закричала его имя и вызвала телепортацию кокона на место событий. Гайвер 3 прямо перед телепортацией обнаружил местоположение кокона и переместился в Токио вместе с ним. Нео-Зэкстол успешно сражался и с Гайвером 3, но очередной крик Мизуки, вызвал раскрытие кокона и появление Гигантик Гайвера, который выстрелив из Гига-сокрушителя уничтожил Нео-Зэкстола... 

    Шо проснулся в том самом доме Нацуки, где компания ждала его возвращения в течении года. Ему пояснили ситуацию и рассказали, что группа учёных, которая помогала им укрываться в горе Минаками скорее всего уже мертва, так как они не добились получения вакцины от вируса, которым Кронос заражал всех своих учёных. В это время в Аризоне был созван совет 12 Зоалордов для решения проблемы с новым Гайвером. Алканфель завершил заседание представлением 13 Зоалорда - Имакарума Мирабилис, который представлял собой тело Масаки Мураками с его памятью, но являлся совсем другой личностью. Имакарум сразу прибыл в Токио, где Гайвер 1 и Гайвер 3 решили напасть на небоскрёб Кроноса - Облачные Врата. Они разделились и Шо в форме Гигантика с лёгкостью прорвался через толпы Зоаноидов, охраняющих здание. Шо и Агито встретились возле входа в командную комнату. Там они встретили Имакарума и завязалась драка. Шо видел в Имакаруме своего друга и поэтому не мог нормально сражаться. К драке присоединился Аптом. Он отнёс Шо в сторону и несколько раз неудачно попытался атаковать Имакарума. Гайвер 3 неожиданно проломил стену и почти достал Имакарума, но всего лишь разрубил ему очки. Имакарум трансформировался в боевую форму и начал действовать жёстче, он схватил Гайвера 1 пытаясь вытащить его Контрольное Устройство и Шо вызвал Гигантика. Он сделал отвлекающий выстрел из Гига-сокрушителя и скрылся вместе с Аптомом и Гайвером 3.

   Через некоторое время на базе на Мёртвом Море 12 Зоалордов провели тесты подняв из воды новое творение Кроноса - огромный космический био-корабль Ковчег (50 км в длину), выращенный из куска ткани уничтоженного Корабля Создателей. Они управляли им мысленно и отправили на околоземную орбиту для дальнейшей подпитки солнечной энергией... Чуть позже Алканфель показал Имакаруму своё убежище на острове Силха, где на его глазах упал теряя сознание и заснул. Имакурум при этом пообещал ему достать блок Био-брони.

   В Токио Аптом встретил живого Хайами (единственный выживший учёный из группы во главе доктора Одагири), который стал теперь Потерянным Номером (единственное средство побороть вирус) и они вместе пришли в дом к Нацуки. Тут же на дом было совершено нападение группы Зоаноидов, это были Ваморы и новый вид Энзаймов - Энзайм 3. Дом был полностью разрушен и компания попыталась оторваться от преследования, но их встретил Имакарум. Аптом и Гайвер 3 защищая компанию начали сражаться с Энзаймами 3, а Гигантик Гайвер взял на себя Имакарума. Аптом захватил троих Энзаймов 3, Гайвер 3 уничтожил их Мега-сокрушителем, но четвёртый Энзайм 3 сумел скрыться под землёй и выпрыгнул прямо перед Агито. Ёхей Онума закрыл Гайвера 3 своим телом и погиб будучи пронзён лапой Энзайма 3, при этом Агито тоже был ранен. Хайами удалось отвлечь Энзайма 3, трансформировавшись в боевую форму и заморозив его, после чего Гайвер 3 разрушил замёрзшее тело Звуковой Атакой. В это время Гигантик Гайвер почти добился успеха - он уже был готов отрубить Имакаруму голову, но опять увидел в нём друга и не смог. Шо снял Гигантскую Био-броню и был схвачен Имакарумом за голову. Агито убедил Гайвера 1 вызвать Гигантика опять и дать ему контроль над ним, потому что Шо был уже на грани смерти и сам не мог одеть Гигантскую Броню. Гайвер 3 трансформировался в Гигантик Дарка, он преследовал Имакарума до густо населённой части Токио и там начал сражение. Имакарум хотел чтобы Гигантик Дарк не мог сражаться в полную силу, полагаясь на то, что он не станет жертвовать мирным населением. Макишиме было безразлично, он умело атаковал Имакарума и в конце концов вынудил его применить Атаку Чёрной Дыры. Эта атка тоже не помогла Имакаруму, Гигантик Дарк разрушил Чёрную Дыру выстрелом из Гига-сокрушителя и тут же нанёс мощный удар рукой прямо по его Зоакристалу. Зоакристал треснул, Агито захотел нанести ещё улар, но потерял контроль над Гигантской Бронёй - она снялась с него из-за истощения энергии. Гайвер 3 почувствовав приближение Зоалорда Пургстала, который спешил разобраться, что происходит, скрылся в глубине моря, Имакарум упал тоже в воду. Тут же появился Алканфель, который был разбужен в момент раскола Зоакристала Имакарума. Он Развёл воду в разные стороны над местом Падения Имакарума и отнёс на остров Силха, где поместил в свою капсулу для выздоровления. Агито решил вернуться к своей организации Молния Зевса в Америке. Он прибыл туда как раз во время атаки на неё Зоаноидов и спас положение... Чуть позже Рихард Гиот живой проходил возле Облачных Врат.

   Аптом устроил для Шо взбучку, заманив его на брошенную фабрику, превратившись в Имакарума и Команду Гипер Зоаноидов 5. Шо показал свою слабость, в этой псевдо драке он потерял контроль над Гигантиком когда Гайвер 3 в Аризоне призвал Гигантскую Броню для себя. Гигантик Дарк сделал вид, что хочет разрушить базу Кроноса в Аризоне. На самом деле его задачей было похищение доктора Альфредо Хеккаринга, который обладал огромными знаниями по Зоаформингу. Устроив погром на базе Гигантик Дарк выкрал его запихнув в грузовой контейнер и перевёз в новое место в горах в Колорадо (США). Там была основана база Молнии Зевса и созданы Зоаноиды Либертус которыми стала командовать Гризельда - Шизу Онума прошедшая процесс превращения в Зоалорда.

   В Токио три Зоалорда, Крумеггник, Джарвил и Кабрал решают выманить и самим захватить Гайвера 1. Они направляют троих Гипер Зоаноидов - Братьев Бранчай, который сливаясь друг с другом формируют тело, похожее на Гигантик Гайвера и начинают сеять разрушение в городе. Шо отправляется за этим "фальшивым Гигантиком", зная, что это ловушка. Он уничтожает его и тут же встречается с Пургсталом, который не знает о замысле троих Зоалордов и считает Гайвера 1 виновным в разрушениях. В ходе драки с Пургсталом Гигантик Гайвер теряет оба Высокочастотных Меча и все Усилители энергии. Пургстал получает серьёзную травму и сражается дальше намного слабее, Гигантик Гайвер пробивает его барьер. Тут в драку вмешиваются троица Зоалордов и Агито, который осуществляет в этот момент нападение на исследовательский центр в Вашингтоне, забирает контроль над Гигантской Бронёй. Аптом выручает Шо, он отвлекает всё внимание Зоалордов на себя и попадает в плен. Гайвер 1 убегает скрывшись под землёй. Трое Зоалордов тут же убивают Пургстала, который понял, что Гайвер 1 был подставлен. На место событий прилетает Зоалорд Шин Рубэо Амникалас и видит труп Пургстала, якобы убитого Гигантик Гайвером. Двое репортёров, Асо и Токивадайра, запечатлевают сцену убийства Пургстала на фотоаппараты.

   Гигантик Дарк тем временем разрушает одну из трёх башен 1000 метрового небоскрёба штаб-квартиры Кроноса в Вашингтоне.

   Алканфель находясь в Ковчеге стреляет из его пушки потоком Био-энергии прямо в Имакарума на острове Силха и тот пробуждается совершенно здоровым. Он направляется на Ковчег, забирает от туда уснувшего Алканфеля и переносит его на Силху.

    Гайвер 1 и Хайами направляются в Облачные Врата чтобы выручить Аптома. Они сражаются с группой Энзаймов 3, проникают в комнату, где держат закаменевшее тело Аптома. Гайвер 1 обнаруживает, что за ними следят - он убивает невидимого Зоаноида - Гастала. Тут же срабатывает какой-то защитный механизм, тело Аптома разрушается. Часть Аптома сливается с Гасталом, но его мозг не может восстановится из-за введённых клеток и Аптом под мысленным управлением Зоалорда Кабрал Хана начинает сражаться с Гайвером 1 и Хайами. Злой Аптом (Аптом 5) становится невидимым и пронзает Хайами ухватив его клешнёй за сердце. Хайами замораживает его и Гайвер 1 стреляет по Аптому из Мега-сокрушителя. Оставшийся кусок плоти Аптома сливается с безжизненным телом Хайами, Аптом восстанавливается в нормальном виде.

   В это же самое время Гигантик Дарк вместе с Гризельдой и группой Зоаноидов Либертус нападают на базу в Аризоне и Агито проникает на нижний уровень базы, к последнему полуразрушенному Кораблю Создателей. Он хочет заполучить Навигационные Сферы корабля. Здесь он ввязывается в драку с тремя Зоалордами - Балкусом, Ли Ентсуи и Ваферданосом. Доктор Балкус до этого запустил отсчёт до самоуничтожения базы. Ли Ентсуи в ходе драки рассечён на двое и находится на грани смерти. В Токио Зоалорд Кабрал приходит в ярость, но переходит в боевую форму Драгонлорда поглощая Зоаноидов со всего Токио. Гайверу 1 удаётся вернуть контроль над Гигантиком, а Агито в Аризоне его лишается и не может восстановить. Либертусы напрыгивают на Ваферданоса и взрываются вместе с ним. Агито хватает Гризельду и в последний момент перед взрывом базы прыгает в портал, который был открыт Ли Ентсуи и через который сбежал Балкус с Навигационными Сферами. Балкус наблюдая с расстояния за взрывом базы получает несколько выстрелов Инфракрасного Лазера Гайвера 3 и падает на землю...

   Кабрал Хан заканчивает трансформацию в Драгонлорда - огромного драконоподобного монстра. Он давит ногой Гигантика и хватает Аптома лапой. Шо высвобождает настоящую силу Гигантика, он трансформируется в Красного Гиганта (Gigantic Exceed, Red Giant) - та же форма, что и Гигантик, но 60 метров в высоту. Драгонлорд отступает под натиском новой силы Гайвера 1, он поглощает ещё зоаноидов, из его спины вырастаю крылья и Драгонлорд взмывает в небо. После чего направляет в сторону Красного Гиганта несколько огромных Био-ракет, которые проникают сквозь барьер и взрываются внутри него. Красный Гигант падает на город, а Кабрал пускает ещё несколько ракет по Токио. Шин видя это быстро трансформируется в боевую форму и сбивает одним выстрелом энергии большинство ракет, оставшиеся падают на город принося огромные разрушения. Красный Гигант пытается сбить одну из ракет и промахивается, видя, что ракета летит прямо в дом, на котором стоят два репортёра - Асо и Такивадайра, Шо закрывает его барьером и принимает удар ракеты на себя. Кабрал готовится выстрелить мощнейшим из своих оружий - Shin Purgatorium, а Шо готовит своё новое оружие - Гравитационную Бездну. Аптом тем временем незаметно приземлился на тело Кабрала и решился на слияние, хотя и знал, что тело Зоалорда защищено от поглощения Зоакристалом также, как и тело Гайвера защищено Контрольным Устройством. В итоге слияние началось, Аптом уже был на полпути к успеху, но Кабрал остановил процесс и выстрелил. Шо произвёл выстрел прямо навстречу выстрелу Кабрала. Гравитационная Бездна засосала и выстрел Кабрала и его огромное тело. Как оказалось, Кабрал сумел спастись, вылетев из тела Драгонлорда внутри Биоракеты, и приземлился на крыше одного из домов. К удивлению Кабрала, на крыше его встретил Аптом в форме Био-Фризера (Хайами Ташиаки). Аптом тут же трансформировался в новую форму - Аптом 6 и заморозил Кабрала. Зоалорд рассыпался, а его Зоакристал начал падение вниз, на улицы города, где его притянул к себе и взял в руку таинственный персонаж в доселе невиданной броне и маске, скрывающей лицо. Тем временем Шо снял броню и его встретили двое репортёров - Асо и Токивадайра, которые тоже наблюдали за битвой.

   Через три месяца, в небоскрёбе штаб-квартиры Кроноса в США, Столбах Небес, Доктор Балкус лежа на больничной койке, принимает у себя Шина. Балкус рассказывает, что после полученных от Гайвера 3 повреждений, он был найден Санитарной Службой в пустыне, а Навигационные Сферы были украдены Гайвером 3. Внезапно Столбы Небес сотрясает и сотрудник Кроноса сообщает Балкусу о взрыве в блоке "D" и о возможном вторжении нарушителя. Отряд Зоаноидов направляется на место и сталкивается с Женщиной Гайвером. Она легко расправляется с ними и проделывает Мегасмашером дыру в небоскрёбе. Балкус объясняет, что учёные Кроноса имели на руках образцы ткани Био-брони и чтобы создать свою собственную броню они создали искусственное КУ. Видимо что-то пошло не по плану. Балкус замечает, что Женщина Гайвер более опасна для Кроноса чем Гайвер 3.

   На поверхность Ковчега телепортируется таинственный Чёрный Рыцарь. Он проникает внутрь, продвигается к центральному уровню, где встречает Зоалорда Эдварда Каэрлеона, который наблюдал за парящими в воздухе Зоакристаллами Пургстала, Ли Ентсуи и Ваферданоса. Эдвард заметил, что Чёрный Рыцарь подчинил своей воле двух Зоаноидов, охранявших эту комнату. Чёрный Рыцарь предлагает Эдварду не сопротивляться и отдать Зоакристаллы по-хорошему. Он показывает свою силу - Эдвард чуствует, что аура Чёрного Рыцаря подавляет его. Чёрный Рыцарь называет себя Аполлионом, предвестником забвения. Эдвард трансорфмируется в боевую форму и начинает сражение с Аполлионом... В это время фотографы Асо и Токивадайра навещают Шо и остальных в их убежище в особняке Одагири. В ходе их разговора Шо высказывает своё намерение сражаться с Кроносом, даже если это будет означать сражение со всем миром.

Это история Аниме... Играть будем почти с начала...